Что такое GPT

таблица разделов жесткого диска. Является усовершенствованным аналогом MBR. Разработан, как один из компонетов EFI и нужен для размещения кода загрузки операционной системы.

Чтобы узнать, какой тип диска используется в Вашей системе (GPT или MBR) нужно сделать следующее:

• В Windows зайти в управление дисками - кликнуть правой кнопкой по нужному диску и зайти в свойства.
• В Linux ввести команду fdisk -l <путь к диску>.

Основные отличия от MBR:

К минусам относится частичная поддержка операционных систем и утилит по работе с диском.

Отвечая на вопрос, что лучше — GPT или MBR, однозначно первый, особенно, если его поддерживает Ваша система.

Подробнее о GPT на Википедии